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论文链接：https://www.nature.com/articles/s42256-026-01214-y 读懂三维原子世界 论文开篇点出，传统材料 AI 要么依赖 DFT 这类高保真但昂贵的方法，要么依赖只处理文本的 LLM；问题在于，文本表示很难显式保留原子结构的三维空间关系与局域环境，因此在性质预测上往往不如图模型。

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图 3：动物模型中模板和 ApexGO 优化肽的抗感染活性。

如何生成既满足受体约束、又具有物理合理性的多肽结构，是 AI 多肽设计中的重要挑战。